激光祛痣的危害一：黏膜的痣。口腔黏膜、结膜、阴道、包皮翻出来那部份的黑痣。
激光祛痣的危害二：指甲沟的痣。甲沟与指甲下方皮肤相连，可能会长到指甲下面，被指甲挡住，不容易看出变化，而且长在肢端，将来变恶性的机率较大。
激光祛痣的危害三：有些痣本身是先天高危险的痣。婴儿一出生就看得到的痣叫先天痣，先天痣不多，根据统计，1%的新生儿有痣，并非所有先天痣都是一生出来就有危险，大小是重要因素。一般来说愈大的痣，将来变恶性的机率较大，因此医师建议应及早切除。
激光祛痣的危害四：出现不典型变化的痣。外观不典型的痣可能变恶性，如很黑的痣，色素不平均(杂色)、边缘不平整或不规则、界线不明、左右不对称、在统计上直径大於5毫米。
激光祛痣的危害五：会受到长期摩擦刺激的痣，如长在戴胸罩处和腰部的痣。
激光祛痣的危害六：单一的痣突然快速变化。如果是全身的痣因为贺尔蒙的变化而同时变化，较无疑虑，如果是单一的痣突然快速变化，就值得注意。