虽然谈到不吃早餐那就是它的危害，不吃早饭对消化系统的危害首当其冲。正常情况下，头天晚上吃的食物经过6小时左右就从胃里排空进入肠道。第二天若不好吃早餐和午餐，胃酸及胃内的各种消化酶就会去“消化”胃黏膜层。长此以往，细胞分泌黏液的正常功能会被破坏，很容易造成胃溃疡及十二指肠溃疡等消化系统疾病。
早餐要尽量少吃油腻的食物，不能因为早上赶着上班或者赖床而不吃早餐。因为在空腹的时候，胆汁容易淤积，极有可能引起结石症状。饮食偏荤喜甜者，也因脂肪和胆固醇摄入多，易形成胆结石。甜食过多又会促进胰岛素分泌，加速胆汁中胆固醇的沉积，形成胆结石。