肉、鱼、剩菜等大多数食物都可以用微波炉来加热，只是有些食物用微波炉加热效果会很差，如水分含量比较低的大饼等，加热之后温度上升不明显，并且由于水分子加热蒸发食物会变得更硬，丧失食物本身的口感。要用微波炉给食物加热，食物本身得有一定的水分，如果没有，就必须得把它放在水里面，这样食物才会熟。
给食品加热最安全的方法是使用微波炉专用玻璃碗。玻璃不存在塑化剂问题，玻璃碗还会配有一个防止食物水分蒸发的耐热性比较好的塑料盖，盖上面设计有小孔，目的是保证透气性，防止盖在加热过程中因为气压差而炸开。除了使用玻璃碗，使用微波炉专用塑料盒也是可以的，专用塑料盒比普通食品塑料袋耐热性更好，更安全。